تجري الحبكة خلال أحداث BORUTO، عندما يكون عالم النينجا في سلام مرةً أخرى مع الهوكاجي المخضرم Naruto او كما يعرف Hokage. يكتشف ابنه بوروتو لعبة شهيرة على شبكة الإنترنت تسمى “Ninja Heroes”، ويلتقي بـ Nanashi، الملاح من اللعبة. في غضون ذلك، يحدث شيء غير عادي في العالم الحقيقي وتهدد حرب النينجا الخامسة العظمى بالاندلاع.
